Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms