Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4aQ8BW72 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4aQ8BW72 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4aQ8BW72 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kdm4aQ8BW72 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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