Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zcchc4Q8BKW4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms