Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tspan9Q8BJU2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms