Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms