Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pcsk9Q80W65 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcsk9Q80W65 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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