Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm42467-201ENSMUST00000202954 1447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Tpt1-ps5-201ENSMUST00000112150 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnphQ80U23 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms