Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NischQ80TM9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NischQ80TM9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms