Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2q1Q7TSS2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms