Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ClmQ7TSN2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms