Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnih3Q6ZWS4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms