Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtifQ6PEE2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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