Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nop58Q6DFW4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms