Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pram1Q6BCL1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pram1Q6BCL1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pram1Q6BCL1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms