Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltcQ68FD5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms