Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Irf4Q64287 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Irf4Q64287 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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