Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQY2

Bod1, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1Q5SQY2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Bod1Q5SQY2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bod1Q5SQY2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms