Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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