Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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