Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc185Q3V118 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Ccdc185Q3V118 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc185Q3V118 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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