Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D13Ertd608eQ3UPR8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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D13Ertd608eQ3UPR8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms