Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CrxosQ3UL53 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms