Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gpr55Q3UJF0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gpr55Q3UJF0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms