Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Parp8Q3UD82 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms