Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc9Q3U0M1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms