Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fndc4Q3TR08 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms