Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ctdnep1Q3TP92 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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