Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usp39Q3TIX9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp39Q3TIX9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp39Q3TIX9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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