Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
F13bQ07968 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms