Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Sh3bp2Q06649 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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