Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnb1Q03717 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms