Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp46P62069 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp46P62069 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp46P62069 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp46P62069 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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