Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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