Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TspoP50637 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
TspoP50637 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TspoP50637 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TspoP50637 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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TspoP50637 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TspoP50637 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TspoP50637 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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