Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VdrP48281 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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VdrP48281 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VdrP48281 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VdrP48281 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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