Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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