Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rplp1P47955 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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