Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nedd4P46935 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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