Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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VhlP40338 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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