Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab6aP35279 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab6aP35279 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms