Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms