Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxc5P32043 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc5P32043 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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