Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msr1P30204 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms