Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tgfb2P27090 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms