Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChgaP26339 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ChgaP26339 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgaP26339 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms