Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PrkcaP20444 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 714 ms