Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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PdgfaP20033 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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PdgfaP20033 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PdgfaP20033 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfaP20033 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms