Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pou4f1P17208 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms