Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms