Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P10404 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P10404 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P10404 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P10404 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P10404 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P10404 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
P10404 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
P10404 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P10404 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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